Originaire de Bussy/Chardonney (VD). Né le 11 novembre 1948 à Marcols-les-Eaux (F, Ardèche). Fils de Gaston Ernest Schifferdecker, pasteur, et de Suzanne Antoinette Schifferdecker, née Grandjean, formation d'institutrice. Marié, deux enfants dont un beau-fils. Protestant.
Baccalauréat ès lettres à Neuchâtel (1969) puis licence ès lettres (archéologie, histoire et histoire de l'art) à l'Université de Neuchâtel (1980). Mémoire en archéologie préhistorique (La céramique du Néolithique moyen de la baie d'Auvernier : étude préliminaire, 1977) honoré du Prix Jean-Pierre Jéquier en 1978.
Compléments de formation à l'Institut d'Anthropologie de l'Université de Genève et au Centre de recherches archéologiques de Valbonne, Sophia Antipolis (France).

Stages de formation d'archéologue sur le terrain en Suisse romande et France voisine (1970-1973). Responsable de recherches sur les sites lacustres néolithiques d'Auvernier et d'Hauterive/Champréveyres (1972-1985). Après différents mandats pour le canton du Jura (1980-1983), il est nommé premier archéologue cantonal du Jura (1er août 1985-31 janvier 2009).
A ce titre, il participe au développement important des recherches archéologiques jurassiennes dans le cadre de la construction de l'autoroute A16 / Transjurane (dès 1986). Les équipes de recherches sur le terrain et en laboratoire compteront rapidement plusieurs dizaines de collaborateurs pour dépasser les 100 dès les années 1995.
Des milliers de sondages et une cinquantaine de fouilles archéologiques ont permis de renouveler totalement les connaissances sur le passé jurassien, du Paléolithique moyen, il y a plus de 100 000 ans aux potiers de Bonfol du XIXe siècle. On peut citer, parmi les chantiers les plus importants : Alle, Les Aiges, Noir Bois et Pré Monsieur ; Boécourt, Les Montoyes ; Boncourt, Les Grand's Combes ; Delémont, En La Pran et La Communance ; Develier-Courtételle, La Pran/Tivila ; Courtedoux, Creugenat ; Saint-Ursanne, Les Gripons.
Dès 2000, mise en place et gestion des recherches paléontologiques dans la cadre de la construction de l'A16 avec, entre autres, la découverte des sites à pistes de dinosaures de Courtedoux.
Au cours de ces 25 ans d'activités, il a été en outre possible de rapatrier, rassembler et mettre partiellement en valeur les anciennes collections archéologiques jurassiennes dispersées soit chez des particuliers, soit dans divers musées suisses, et déposées aujourd'hui à l'Office de la Culture à Porrentruy.

Fondateur de la collection des Cahiers d'archéologie jurassienne, il dirige les vingt premiers volumes et participe de près aux dix suivants.
Membre du comité (1977-1983) puis président (1983-1986) du Groupe de travail pour les recherches préhistoriques et protohistoriques en Suisse. Membre du comité (1987-1993) puis président (1994-1996) de la Société suisse de Préhistoire et d'Archéologie. Membre fondateur, secrétaire et responsable scientifique du Cercle d'archéologie de la Société jurassienne d'Emulation (1990-2011).
Créateur, en collaboration avec le Service archéologique de Franche-Comté (Annick Richard), des Journées archéologiques frontalières de l'Arc jurassien (JAFAJ) qui ont eu lieu à Delle et Boncourt en 2005 et 2007 (actes parus en 2007 et à paraître en 2012).
Co-responsable du projet Interreg IIIa sur la piste des dinosaures jurassiques de l'Arc jurassien en collaboration avec le Département français du Jura (Marie-Jeanne Roulière-Lambert) : exposition Paleomania, film de Jean-Luc Bouvret Sur la piste des dinosaures jurassiens, ouvrage Jurassique'Jura. Métamorphoses d'un paysage, site internet lejurassique.com, malettes pédagogiques (2006-2008).

Principales publications personnelles : - « Néolithique et Bronze ancien à Auvernier », Bulletin de la Société suisse de Préhistoire et d'Archéologie, 30-31, 1977, p. 5-21
- « Auvernier et la céramique de la civilisation de Cortaillod en Suisse occidentale », Bulletin de la Société préhistorique française, 76'2, 1978, p. 46-54
- La céramique du Néolithique moyen de la baie d'Auvernier dans son cadre régional, Lausanne, 1982 (Cahier d'archéologie romande, 24 ; Auvernier, 4)
- « La baie d'Auvernier, topographie et stratigraphies », in BILLAMBOZ A. et al. La station littorale d'Auvernier-Port. Cadre et évolution, Lausanne, 1982, p. 131-141 (Cahier d'archéologie romande, 25 ; Auvernier, 5)
- « Nécropole d'époque mérovingienne à Courfaivre/Jura », Helvetia archaeologica 13, 50, 1982, p. 61-70
- « Note à propos de la densité de l'habitat néolithique à Auvernier (Neuchâtel, Suisse) », in Actes du 8e colloque interrégional sur le Néolithique, Le Puy, 1981, Clermont-Ferrant, Centre de Recherches préhistoriques d'Auvergne, 1, 1983, p. 275-279
- « Découvertes archéologiques mérovingiennes dans le Canton suisse du Jura », Bulletin de liaison de l'Association française d'archéologie mérovingienne 14, 1990, p. 34-39
- « La vallée de Delémont (Jura, Suisse) et l'Age du Bronze », in Un monde villageois : habitat et milieu naturel en Europe de 2000 à 500 av. J.-C., Lons-le-Saunier, 1990, p. 143-151
- « De la pierre taillée au scramasaxe, toujours avec l'Homme », in WENGER éd., La passion du couteau, Delémont, 1993, p. 1-11
- « Sous la Transjurane, prospection et sondages entre Porrentruy et Delémont », Archéologie suisse, 17, 1994, p. 31 35
- « Trois lustres d'archéologie dans le canton du Jura », 1981-1996, ASJE 100, 1997, p. 269-309
- « Archéologie et Transjurane : dix années de recherches dans le canton du Jura », Colloque de l'Institut jurassien des Sciences, des Lettres et des Arts, Tramelan, septembre 1996, Cahiers de l'Institut jurassien des Sciences, des Lettres et des Arts, Porrentruy, 4, 1997, p. 19-20
- « Echappées archéologiques dans les brumes du Haut Moyen Age », in REBETEZ J.-C. réd. La donation de 999 et l'histoire médiévale de l'ancien Evêché de Bâle, Porrentruy, Fondation des Archives de l'Ancien Evêché de Bâle, 2002, p. 375-394

Principales études en collaboration :

- SCHIFFERDECKER F., LENOBLE P. et LAMBERT G.-N. « Au bord du lac de Neuchâtel, les stations littorales d'Auvernier », Archeologia 74, 1974, p. 58-65
- BOISAUBERT J.-L., SCHIFFERDECKER F. et PETREQUIN P., « Les villages néolithiques de Clairvaux (Jura, France) et d'Auvernier (Neuchâtel, Suisse). Problèmes d'interprétation des plans », Bulletin de la Société préhistorique française, 71, 1974, p. 355-382
- SCHIFFERDECKER F. et BEECHING A. « Le site d'Auvernier, Brise-Lames et les relations du Groupe de Lüscherz avec le Groupe d'Auvernier », in Strahm C., Thévenot J.-P. et al. La civilisation Saône-Rhône, Revue archéologique de l'Est 27, 1976, p. 381-386
- MAGNY M. et SCHIFFERDECKER F. « Essai sur l'occupation du sol au Néolithique : le Groupe de Lüscherz », Bulletin de la Société préhistorique française, 77, 1980, p. 17-25
- BILLAMBOZ A. et SCHIFFERDECKER F. « La mise à profit de la ramure dans l'industrie sur bois de cervidés d'Auvernier, Port, et d'Auvernier, Brise-Lames, (NE, Suisse) », in CAMPS-FABRER (éd), L'industrie en os et bois de cervidé durant le Néolithique et l'âge des métaux, 2, Paris, CNRS, 1982, p. 60-76
- SCHIFFERDECKER F. et AL. Le site littoral néolithique d'Auvernier, Brise-Lames (NE, Suisse) ; stratigraphie et environnement, Lausanne, 1982 (Cahier d'archéologie romande, 46 , Auvernier 8)
- SCHIFFERDECKER F. et BOISAUBERT J.-L. « La céramique du Néolithique récent dans la région des trois lacs de Neuchâtel, Bienne et Morat (Suisse). Essai de définition et évolution », in Eléments de Pré et Protohistoire européenne. Hommages à Jacques-Pierre Millotte, Paris, Les Belles Lettres, 1984, p. 251-264 (Annales littéraires de l'Université de Besançon, 299)
- BENKERT  A., REINHARD J. et SCHIFFERDECKER F. « Chasseurs de rennes et paysans des temps lacustres dans la baie de Champréveyres » Archéologie suisse, 7, 1984, p. 42-53
- BURRI Nathalie, JOYE Catherine, RYCHNER-FARAGGI Anne-Marie et SCHIFFERDECKER François, « Découverte d'un village littoral de la Civilisation de Cortaillod à Hauterive-Champréveyres (Neuchâtel, Suisse) » Annuaire de la Société suisse de Préhistoire et d'Archéologie, 70, 1987, p. 35-50
- SCHIFFERDECKER François et SPITALE. Denis, « Cinq monnaies romaines à Glovelier, Bone en Bez », Archéologie suisse 10, 1987, p. 67-69
- KAENEL Gilbert, MOREL Philippe, MÜLLER Felix et SCHIFFERDECKER François, «  Au pied du Lomont, la bâme aux Pirotas et la grotte de Vaberbin », Archéologie suisse 10, 1987, p. 61-66
- MOREL Philippe et SCHIFFERDECKER François, « La bâme de Courtemaîche, étude archéologique et paléontologique », Archéologie suisse 10, 1987, p. 53-60
- PACCOLAT Olivier et SCHIFFERDECKER François, « Un lot de céramique gallo romaine découvert à Lajoux (JU), Puits Willy », Annuaire de la Société suisse de Préhistoire et d'Archéologie 75, 1992, p. 167 176, 4fig., 2 pl.
- MOREL Philippe et SCHIFFERDECKER François, « Homme et ours des cavernes (ursus spelaeus) au Pléistocène supérieur dans les grottes de l'Arc jurassien de Suisse occidentale : bilan et nouvelles données chronologiques », in Proceedings of the 12th International Congress of Speleology, vol 3, Symposium 2 : Archeology and paleontology in caves. La Chaux-de-Fonds, 10th-17th august 1997. International Union of Speleology and Swiss Speleological Society, La Chaux-de-Fonds, 1997, p. 137-140
- JUILLERAT Claude, SCHIFFERDECKER François et al. Guide archéologique du Jura et du Jura bernois, Porrentruy, Société jurassienne d'Emulation, 1997
- SCHIFFERDECKER François et STAHL GRETSCH Laurence-Isaline, « Hypothèse de peuplement du Jura. L'apport des sondages de la Transjurane », Archéologie suisse 21, 1998, p. 90-95
- SCHIFFERDECKER François (dir.), « Trésors archéologiques au fil de la Transjurane », Jura Pluriel 36, 2000
- DUNNING Cynthia et SCHIFFERDECKER François, « Esquisse sur le peuplement [du Jura] d'après les recherches récentes », Archéologie suisse 28-2, 2005, p. 2-5
- BELET-GONDA Cécile, MAZIMANN Jean-Pierre, RICHARD Annick et SCHIFFERDECKER François (dir.), Premières journées archéologiques frontalières de l'Arc jurassien. Actes. Delle (F) ' Boncourt (CH), 21-22 octobre 2005. Mandeure, sa campagne et ses relations d'Avenches à Luxeuil et d'Augst à Besançon. Actualités archéologiques régionales, Presses universitaires de Franche-Comté, Office de la culture et Société jurassienne d'Emulation, Besançon et Porrentruy,2007 (Annales littéraires de l'Université de Franche-Comté 816, Série environnement, sociétés et archéologie 10, et Cahier d'archéologie jurassienne 20)
- ROULIERE-LAMBERT Marie-Jeanne et SCHIFFERDECKER François (réd.), Jurassique' Jura ; métamorphoses d'un paysage, Lons-le-Saunier, Centre jurassien du Patrimoine et Porrentruy, Société jurassienne d'Emulation,2007
- ROULIERE-LAMBERT Marie-Jeanne, SCHIFFERDECKER François et LENG Stéphane (réd.), Orgelet, vive, forte et robuste, Lons-le-Saunier, Centre jurassien du Patrimoine, 2008 (Franche-Comté, Itinéraires jurassiens 9)
- ROULIERE-LAMBERT Marie-Jeanne, SCHIFFERDECKER François (réd.), Salins-les-Bains, franche et libre, Montaigu, Mêta Jura, 2011 (Franche-Comté, Itinéraires jurassiens 10)

Principaux manuscrits :

- Répertoire des sites archéologiques de la République et Canton du Jura, Porrentruy, Office du Patrimoine historique, 1981, 207 p. (polycopié) (dossier d'archéologie n° 1). (2e édition revue et augmentée en 1997, en coll. avec S. Stékoffer, 198 p. (dossier d'archéologie n° 41); 3e éd. revue et augmentée en cours de rédaction)
- Bibliographie archéologique jurassienne 1981-1998, Porrentruy, Office du Patrimoine historique, 1998, 2 tomes, 860 p. (polycopié) (Dossiers d'archéologie n° 49 et 50)
- Bibliographie archéologique jurassienne 1998-2003, Porrentruy, Office du Patrimoine historique, 2003, 344 p. (polycopié) (Dossier d'archéologie n° 79)