Chapitre collégial dont l'activité est attestée du 12e au 16e siècle. Un acte de 1177 fait mention d'un Theodoric, prévôt de St-Imier. Cette mention nous apprend que le monastère s'est donc transformé, à une date inconnue, en un chapitre composé d'un prévôt, d'un vice-prévôt et de dix autres chanoines. Contrairement aux moines, les chanoines vivent dans le siècle, ils n'habitent pas forcément au siège du chapitre et se partagent les bénéfices des domaines. La transformation de couvent en chapitre était courante au 12e siècle dans les diocèses de Bâle et de Lausanne. Les premiers statuts connus du chapitre datent de 1317. Ils cherchent avant tout à obliger les chanoines à résider à St-Imier et à s'occuper de leur charge au sein du chapitre, notamment en distribuant les prébendes en quatre fois contre une auparavant. Le chapitre est pauvre mais il possède trois collatures (Tramelan, Dombresson et Serrière) ainsi que quelques biens le long du lac de Bienne et en Erguël, mais il n'a pas de droits politiques. Dès 1335, l'influence de Bienne sur le chapitre est confirmée par un traité de combourgeoisie. En mars 1530, l'Erguël adopte la Réforme. Elle est votée par la majorité de la population, tous les curés en fonction et trois des chanoines. Les autres, restés catholiques reçoivent une pension. Les objets de valeur de la collégiale de St-Imier sont transportés à Bienne. Les titres de propriété et le trésor du chapitre sont déposés dans un coffre au château de Porrentruy. En 1534, le chapitre conclut un traité de combourgeoisie avec Soleure qui accueille les chanoines et leur cède le couvent des Franciscains. Ils ne sont cependant que quatre à s'y installer. Le dernier chanoine meurt en 1574.

Prévôts du chapitre de Saint-Imier 1177 Theodoric de (Novacastro 1178 Borchardus 1220 Burchardus 1239-1256 Rodolphe 1277-1293 Johannes 1295-1296 Bourcard de Tavannes 1317-1322 Nicolas de Courrendlin av. 1334 Jean de Courtelary 1340-1357 Louis de Blonay 1372 Henri de Bereillon 1380 Peter 1417 Henri Nerr, abbé de Bellelay de 1401 à 1424/27 1428-1429 Jean Nerr 1432-1466/67 Henri Nerr 1467-1478 Jean Minodi 1478 Vincenz de Ruvere 1479 Humbert Goeuffi 1479-1509 Jean Ulfinger 1509-1510 Jean de Coeuve 1512-1544 Jean Belleney