Originaire de Soyhières. Né le 17 octobre 1962 à Delémont. Fils de Bernard Mertenat, ingénieur civil, et de Mariette née Aubry. Epouse Janick Prince, commerçante. Trois enfants. Catholique.
Après avoir obtenu un CFC de dessinateur en génie civil (1980-1983), M. poursuit ses études comme ingénieur civil à Yverdon (1983-1986). De 1986 à 1991, il travaille comme ingénieur avec spécialisation en géotechnique et travaux souterrains dans différents bureaux de Baden (AG) puis, de 1992 à 1999, au sein du bureau familial à Moutier et Delémont. Dès 2000, il est nommé ingénieur au Service des ponts et chaussées (depuis 2013: Service des infrastructures SIN) du canton du Jura à Delémont. Il en devient chef dès 2014.
En 1993, M. adhère au Parti démocrate-chrétien, dont il devient le président de la section delémontaine pendant 15 ans jusqu'en 2017, ainsi que secrétaire général sur le plan cantonal jusqu'en 2016. Il siège comme député au Parlement jurassien de 1995 à 1999. Il y est membre de la commission de coopération et réunification. En 2001, il est élu au Conseil de ville de Delémont.
Membre du Groupe Bélier et du Mouvement autonomiste jurassien (MAJ). Membre de la Jeune chambre économique du district de Delémont (président en 1993).